任何具有竞争性质的领域都存在博弈行为，博弈是竞争的重要属性。形成军民融合深度发展格局，需要军民融合各方具有一种博弈的大视野，认清军民融合要义，允许军民融合各方试错容错，最终找到适合中国国情的军民融合新模式，加快实现经济建设与国防建设的协调发展。
军民融合是一种重复博弈。参与人之间重复和持续的关系是重复博弈的典型特征。重复博弈最大的特点是能够提高各方整体合作。比如，武器装备科研生产等领域的企业间一旦建立了合作关系，就会演变成一种长期伙伴关系，因为重新寻找新的合作伙伴需要付出更多的交易成本和摩擦成本，特别是军工领域的一定准入限制也强化了双方重复合作的可能。
军民融合是一种演化博弈。进化论告诉我们，人类面对比较复杂的选择问题时常常凭直觉与本能行动，并非根据优化分析后才做出决策，人们往往不会一开始就找到最优解，会通过反复试错寻找较好的策略。这意味着经常有部分博弈方不会采用完全理性博弈策略，意味着均衡是不断调整和改进的。目前，我国民企大部分尚未进入国防领域，那些可能进入国防领域的，则需要通过模仿学习先行者，及时调整参与策略。同时，军方有些项目也尚未向社会开放。潜在的军民融合双方均属于有限理性群体。对于军民融合参与者而言，需要持续研究其种群及个体行为之间的相互影响。
军民融合是一种联盟协调博弈。建设军民融合示范区或示范基地，可以促进军民融合，但这种示范主体需要各方通力合作才有可能取得成功。军民各企业间通过契约合作方式，将拥有先进生产与服务技术的供需各方联合起来，进行过程重组、产品开发、生产制造、利益分配；地方政府、部门在军民融合过程中起着主导作用，诸如提出融合规划、完善基础设施、搭建信息平台、提供政策支持，协调军企和民企各项事宜。博弈实验表明：一旦博弈被嵌入到一些共享的社会背景中，参与人有惊奇的能力通过共享成绩来协调他们的行为。所以，联盟协调在构建军民融合模式实践中扮演着重要角色。
在博弈中建立军民融合试错容错机制。要找到一条具有中国特色的军民融合路子不是一件容易的事，势必要经过许多艰难困苦，所以必须加快建立军民融合改革创新的试错容错机制，在制度设计上保证正确的融合方向，解除人们的后顾之忧，激励想干事、能干事者轻装上阵，积极投身军民融合大潮。其中有两个问题需要解决：一是把握好政策边界，解决容哪些错的问题，把因缺乏经验、先行先试出现的错误同明知故犯的违法行为区别开来，不让试错容错成为逃避处罚的借口和挡箭牌；二是要做好制度衔接，解决怎么纠错的问题，在制度设计上增加纠错环节作为后续的补救措施，让试错、容错、纠错良性循环，减少人为因素带来的风险。
在博弈中建立军民融合利益分享补偿与协调机制。在探索中国特色的军民融合模式中，处处充斥着合作各方多元利益关系的博弈。比如，军队更多关注政治与军事利益，地方政府兼顾政治与经济利益，军民企业和部门则更重视经济利益，而且军民融合活动本身是一种跨区域、跨部门的经济活动，不受行政隶属关系制约，多元利益的追求容易使军民融合流于形式。此时，协调机制尤其重要。合理的利益分享补偿与协调机制有利于缓解利益的矛盾与冲突，减少合作摩擦，有利于平衡与协调各方利益分配，保证军民融合的可持续发展和长期利益的实现。
